Using nanofluidic channels to probe dynamics of RAD51-Filaments

Louise Fornander; Mohammadreza Alizadehheidari; E. Werner; A. Çekir; Joachim Fritzsche; J. Araya; P. Nevin; P. J. Beuning; Bernhard Mehlig; M. Modesti; Karolin Frykholm; F. Persson; Fredrik Westerlund

Using nanofluidic channels to probe dynamics of RAD51-Filaments
Paper i proceeding, 2015

Using nanochannels, passivated with a lipid bilayer to avoid sticking of proteins, we study Rad51 filaments bound to single- and double stranded DNA. We demonstrate how we can discern different properties of the filaments by studying them at different degrees of confinement. Unlike the bacterial homologue RecA, that forms homogeneous filaments along DNA, Rad51 forms heterogeneous filaments containing both rigid kinks as well as flexible regions. Varying the counterion, the DNA substrate as well as the initial protein concentration, we try to understand the factors governing the structure of the filaments.

Lipid passivation

Nanofluidics

Rad51

DNA-protein interactions

Författare

Louise Fornander

Chalmers, Kemi och kemiteknik, Kemi och biokemi

Forskning Andra publikationer

Mohammadreza Alizadehheidari

Chalmers, Kemi och kemiteknik, Kemi och biokemi

Forskning Andra publikationer

E. Werner

Goteborgs Universitet

A. Çekir

Goteborgs Universitet

Joachim Fritzsche

Chalmers, Teknisk fysik, Kemisk fysik

Forskning Andra publikationer

J. Araya

Northeastern University

P. Nevin

Northeastern University

P. J. Beuning

Northeastern University

Bernhard Mehlig

Goteborgs Universitet

M. Modesti

Aix Marseille Universite

Karolin Frykholm

Chalmers, Biologi och bioteknik, Kemisk biologi

Forskning Andra publikationer

F. Persson

Uppsala Universitet

Fredrik Westerlund

Chalmers, Kemi och kemiteknik, Kemi och biokemi

Forskning Andra publikationer

18th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2014

1826-1828
978-097980647-6 (ISBN)

Styrkeområden

Nanovetenskap och nanoteknik

Livsvetenskaper och teknik (2010-2018)

Ämneskategorier (SSIF 2011)

Biokemi och molekylärbiologi

ISBN

978-097980647-6

Mer information

Skapat

2017-10-07

Using nanofluidic channels to probe dynamics of RAD51-Filaments Paper i proceeding, 2015

Författare

Louise Fornander

Mohammadreza Alizadehheidari

E. Werner

A. Çekir

Joachim Fritzsche

J. Araya

P. Nevin

P. J. Beuning

Bernhard Mehlig

M. Modesti

Karolin Frykholm

F. Persson

Fredrik Westerlund

18th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2014

Styrkeområden

Ämneskategorier (SSIF 2011)

ISBN

Mer information

Skapat

Using nanofluidic channels to probe dynamics of RAD51-Filaments
Paper i proceeding, 2015