The cancer genome atlas pan-cancer analysis project

J. N. Weinstein; E. A. Collisson; G. B. Mills; K. R. M. Shaw; B. A. Ozenberger; K. Ellrott; C. Sander; J. M. Stuart; K. Chang; C. J. Creighton; C. Davis; L. Donehower; J. Drummond; D. Wheeler; A. Ally; M. Balasundaram; I. Birol; Y. S. N. Butterfield; A. Chu; E. Chuah; H. J. E. Chun; N. Dhalla; R. Guin; M. Hirst; C. Hirst; R. A. Holt; S. J. M. Jones; D. Lee; H. I. Li; M. A. Marra; M. Mayo; R. A. Moore; A. J. Mungall; A. G. Robertson; J. E. Schein; P. Sipahimalani; A. Tam; N. Thiessen; R. J. Varhol; R. Beroukhim; A. S. Bhatt; A. N. Brooks; A. D. Cherniack; S. S. Freeman; S. B. Gabriel; E. Helman; J. Jung; M. Meyerson; A. I. Ojesina; C. S. Pedamallu; G. Saksena; S. E. Schumacher; B. Tabak; T. Zack; E. S. Lander; C. A. Bristow; A. Hadjipanayis; P. Haseley; R. Kucherlapati; SangWook Lee; E. Lee; L. J. Luquette; H. S. Mahadeshwar; A. Pantazi; M. Parfenov; P. J. Park; A. Protopopov; X. Ren; N. Santoso; J. Seidman; S. Seth; X. Song; J. Tang; R. Xi; A. W. Xu; L Yang; D. Zeng; J. T. Auman; S. Balu; E. Buda; C. Fan; K. A. Hoadley; C. D. Jones; S. Meng; P. A. Mieczkowski; J. S. Parker; C. M. Perou; J. Roach; Y. Shi; G. O. Silva; D. Tan; U. Veluvolu; S. Waring; M. D. Wilkerson; J. Wu; W. Zhao; T. Bodenheimer; D. N. Hayes; A. P. Hoyle; S. R. Jeffreys; L. E. Mose; J. V. Simons; M. G. Soloway; S. B. Baylin; B. P. Berman; M. S. Bootwalla; L. Danilova; J. G. Herman; T. Hinoue; P. W. Laird; S. K. Rhie; H. Shen; T. Triche; D. J. Weisenberger; S. L. Carter; K. Cibulskis; L. Chin; J Zhang; C. Sougnez; M. Wang; G. Getz; H. Dinh; H. V. Doddapaneni; R. Gibbs; P. Gunaratne; Y. Han; D. Kalra; C. Kovar; L. Lewis; M. Morgan; D. Morton; D. Muzny; J. Reid; L. Xi; J. Cho; D. Dicara; S. Frazer; N. Gehlenborg; D. I. Heiman; J. Kim; M. S. Lawrence; P. Lin; Y. Liu; M. S. Noble; P. Stojanov; D. Voet; H. Zhang; L. Zou; C. Stewart; B. Bernard; R. Bressler; A. Eakin; L. Iype; T. Knijnenburg; R. Kramer; R. Kreisberg; K. Leinonen; J. Lin; Y Liu; M. Miller; S. M. Reynolds; H. Rovira; I. Shmulevich; V. Thorsson; D. Yang; W. Zhang; S. Amin; Chengjie Wu; C. C. Wu; R. Akbani; K. Aldape; K. A. Baggerly; B. Broom; T. D. Casasent; J. Cleland; D. Dodda; M. Edgerton; L. Han; S. M. Herbrich; Z. Ju; H. Kim; S. Lerner; J. Li; H. Liang; W. Liu; P. L. Lorenzi; Y. Lu; J. Melott; L. Nguyen; X. Su; R. Verhaak; W. Wang; A. Wong; Y. Yang; J. Yao; R. Yao; K. Yoshihara; Y. Yuan; A. K. Yung; N. Zhang; S. Zheng; M. Ryan; D. W. Kane; B. A. Aksoy; G. Ciriello; G. Dresdner; J. Gao; B. Gross; A. Jacobsen; A. Kahles; M. Ladanyi; W. Lee; K. V. Lehmann; M. L. Miller; R. Ramirez; G. Rätsch; B. Reva; N. Schultz; Y. Senbabaoglu; R. Shen; R. Sinha; S. O. Sumer; Y. Sun; B. S. Taylor; N. Weinhold; S. Fei; P. Spellman; C. Benz; D. Carlin; M. Cline; B. Craft; M. Goldman; D. Haussler; S. Ma; S. Ng; E. Paull; A. Radenbaugh; S. Salama; A. Sokolov; T. Swatloski; V. Uzunangelov; P. Waltman; C. Yau; J. Zhu; S. R. Hamilton; S. Abbott; R. Abbott; N. D. Dees; K. Delehaunty; L. Ding; D. J. Dooling; J. M. Eldred; C. C. Fronick; R. Fulton; L. L. Fulton; J. Kalicki-Veizer; K. L. Kanchi; C. Kandoth; D. C. Koboldt; D. E. Larson; T. J. Ley; L. Lin; C. Lu; V. J. Magrini; E. R. Mardis; M. D. McLellan; J. F. McMichael; C. A. Miller; M. O'Laughlin; C. Pohl; H. Schmidt; S. M. Smith; J. Walker; J. W. Wallis; M. C. Wendl; R. K. Wilson; T. Wylie; Q. Zhang; R. Burton; M. A. Jensen; A. Kahn; T. Pihl; D. Pot; Y. Wan; D. A. Levine; A. D. Black; J. Bowen; J. Frick; J. M. Gastier-Foster; H. A. Harper; C. Helsel; K. M. Leraas; T. M. Lichtenberg; C. McAllister; N. C. Ramirez; S. Sharpe; L. Wise; E. Zmuda; S. J. Chanock; T. Davidsen; J. A. Demchok; G. Eley; I. Felau; M. Sheth; H. Sofia; L. Staudt; R. Tarnuzzer; Z. Wang; L. Yang; J. Zhang; L. Omberg; A. Margolin; B. J. Raphael; F. Vandin; H. T. Wu; M. D. M. Leiserson; S. C. Benz; C. J. Vaske; H. Noushmehr; D. Wolf; L. V. Veer; D. Anastassiou; T. H. O. Yang; N. Lopez-Bigas; A. Gonzalez-Perez; D. Tamborero; Z. Xia; W. Li; D. Y. Cho; T. Przytycka; M. Hamilton; S. McGuire; Sven Nelander; P. Johansson; Rebecka Jörnsten; Teresia Kling; José Sánchez

doi:10.1038/ng.2764

The cancer genome atlas pan-cancer analysis project
Journal article, 2013

The Cancer Genome Atlas (TCGA) Research Network has profiled and analyzed large numbers of human tumors to discover molecular aberrations at the DNA, RNA, protein and epigenetic levels. The resulting rich data provide a major opportunity to develop an integrated picture of commonalities, differences and emergent themes across tumor lineages. The Pan-Cancer initiative compares the first 12 tumor types profiled by TCGA. Analysis of the molecular aberrations and their functional roles across tumor types will teach us how to extend therapies effective in one cancer type to others with a similar genomic profile.

Author

J. N. Weinstein

E. A. Collisson

G. B. Mills

K. R. M. Shaw

B. A. Ozenberger

K. Ellrott

C. Sander

J. M. Stuart

K. Chang

C. J. Creighton

C. Davis

L. Donehower

J. Drummond

D. Wheeler

A. Ally

M. Balasundaram

I. Birol

Y. S. N. Butterfield

A. Chu

E. Chuah

H. J. E. Chun

N. Dhalla

R. Guin

M. Hirst

C. Hirst

R. A. Holt

S. J. M. Jones

D. Lee

H. I. Li

M. A. Marra

M. Mayo

R. A. Moore

A. J. Mungall

A. G. Robertson

J. E. Schein

P. Sipahimalani

A. Tam

N. Thiessen

R. J. Varhol

R. Beroukhim

A. S. Bhatt

A. N. Brooks

A. D. Cherniack

S. S. Freeman

S. B. Gabriel

E. Helman

J. Jung

M. Meyerson

A. I. Ojesina

C. S. Pedamallu

G. Saksena

S. E. Schumacher

B. Tabak

T. Zack

E. S. Lander

C. A. Bristow

A. Hadjipanayis

P. Haseley

R. Kucherlapati

SangWook Lee

E. Lee

L. J. Luquette

H. S. Mahadeshwar

A. Pantazi

M. Parfenov

P. J. Park

A. Protopopov

X. Ren

N. Santoso

J. Seidman

S. Seth

X. Song

J. Tang

R. Xi

A. W. Xu

L Yang

D. Zeng

J. T. Auman

S. Balu

E. Buda

C. Fan

K. A. Hoadley

C. D. Jones

S. Meng

P. A. Mieczkowski

J. S. Parker

C. M. Perou

J. Roach

Y. Shi

G. O. Silva

D. Tan

U. Veluvolu

S. Waring

M. D. Wilkerson

J. Wu

W. Zhao

T. Bodenheimer

D. N. Hayes

A. P. Hoyle

S. R. Jeffreys

L. E. Mose

J. V. Simons

M. G. Soloway

S. B. Baylin

B. P. Berman

M. S. Bootwalla

L. Danilova

J. G. Herman

T. Hinoue

P. W. Laird

S. K. Rhie

H. Shen

T. Triche

D. J. Weisenberger

S. L. Carter

K. Cibulskis

L. Chin

J Zhang

C. Sougnez

M. Wang

G. Getz

H. Dinh

H. V. Doddapaneni

R. Gibbs

P. Gunaratne

Y. Han

D. Kalra

C. Kovar

L. Lewis

M. Morgan

D. Morton

D. Muzny

J. Reid

L. Xi

J. Cho

D. Dicara

S. Frazer

N. Gehlenborg

D. I. Heiman

J. Kim

M. S. Lawrence

P. Lin

Y. Liu

M. S. Noble

P. Stojanov

D. Voet

H. Zhang

L. Zou

C. Stewart

B. Bernard

R. Bressler

A. Eakin

L. Iype

T. Knijnenburg

R. Kramer

R. Kreisberg

K. Leinonen

J. Lin

Y Liu

M. Miller

S. M. Reynolds

H. Rovira

I. Shmulevich

V. Thorsson

D. Yang

W. Zhang

S. Amin

Chengjie Wu

C. C. Wu

R. Akbani

K. Aldape

K. A. Baggerly

B. Broom

T. D. Casasent

J. Cleland

D. Dodda

M. Edgerton

L. Han

S. M. Herbrich

Z. Ju

H. Kim

S. Lerner

J. Li

H. Liang

W. Liu

P. L. Lorenzi

Y. Lu

J. Melott

L. Nguyen

X. Su

R. Verhaak

W. Wang

A. Wong

Y. Yang

J. Yao

R. Yao

K. Yoshihara

Y. Yuan

A. K. Yung

N. Zhang

S. Zheng

M. Ryan

D. W. Kane

B. A. Aksoy

G. Ciriello

G. Dresdner

J. Gao

B. Gross

A. Jacobsen

A. Kahles

M. Ladanyi

W. Lee

K. V. Lehmann

M. L. Miller

R. Ramirez

G. Rätsch

B. Reva

N. Schultz

Y. Senbabaoglu

R. Shen

R. Sinha

S. O. Sumer

Y. Sun

B. S. Taylor

N. Weinhold

S. Fei

P. Spellman

C. Benz

D. Carlin

M. Cline

B. Craft

M. Goldman

D. Haussler

S. Ma

S. Ng

E. Paull

A. Radenbaugh

S. Salama

A. Sokolov

T. Swatloski

V. Uzunangelov

P. Waltman

C. Yau

J. Zhu

S. R. Hamilton

S. Abbott

R. Abbott

N. D. Dees

K. Delehaunty

L. Ding

D. J. Dooling

J. M. Eldred

C. C. Fronick

R. Fulton

L. L. Fulton

J. Kalicki-Veizer

K. L. Kanchi

C. Kandoth

D. C. Koboldt

D. E. Larson

T. J. Ley

L. Lin

C. Lu

V. J. Magrini

E. R. Mardis

M. D. McLellan

J. F. McMichael

C. A. Miller

M. O'Laughlin

C. Pohl

H. Schmidt

S. M. Smith

J. Walker

J. W. Wallis

M. C. Wendl

R. K. Wilson

T. Wylie

Q. Zhang

R. Burton

M. A. Jensen

A. Kahn

T. Pihl

D. Pot

Y. Wan

D. A. Levine

A. D. Black

J. Bowen

J. Frick

J. M. Gastier-Foster

H. A. Harper

C. Helsel

K. M. Leraas

T. M. Lichtenberg

C. McAllister

N. C. Ramirez

S. Sharpe

L. Wise

E. Zmuda

S. J. Chanock

T. Davidsen

J. A. Demchok

G. Eley

I. Felau

M. Sheth

H. Sofia

L. Staudt

R. Tarnuzzer

Z. Wang

L. Yang

J. Zhang

L. Omberg

A. Margolin

B. J. Raphael

F. Vandin

H. T. Wu

M. D. M. Leiserson

S. C. Benz

C. J. Vaske

H. Noushmehr

D. Wolf

L. V. Veer

D. Anastassiou

T. H. O. Yang

N. Lopez-Bigas

A. Gonzalez-Perez

D. Tamborero

Z. Xia

W. Li

D. Y. Cho

T. Przytycka

M. Hamilton

S. McGuire

Sven Nelander

P. Johansson

Rebecka Jörnsten

University of Gothenburg

Chalmers, Mathematical Sciences, Mathematical Statistics

Other publications Research

Teresia Kling

José Sánchez